肾结石与胆结石不同的是，胆结石如果无出现症状，未必需要处理，但如果无意中发现的是肾结石，例如通过体检或其他检查时发现，无论有否出现症状，医生普遍都会建议患者把结石清除。泌尿系统结石的症状包括疼痛、发炎、发烧及血尿等，但医生最担心的，就是结石将泌尿系统堵塞而没有出现症状，最后在患者毫不察觉的情况下将肾脏堵坏。
很多病人会问：「明明排尿顺畅，为什么说我的输尿管被结石堵塞？」能否顺利排尿并不是一个良好的参考指标，因为人体有两个肾，即使其中一边被堵塞，另一边的肾脏依然会继续运作，所以病人仍可以顺利排尿。当结石卡在输尿管上，该边的肾脏会出现疼痛、有机会发炎。但相关症状并不一定会出现，就曾遇过一些肾脏出现问题的病人，其中一边肾胀坏了，详细验查之下才发现有结石卡在输尿管上，使尿液长期不能流下。这反映出该名病人的输尿管已被堵塞多年。
治疗方面，泌尿系统中的结石是无法透过药物将之溶解；医生会根据结石的大小、位置等，利用多种不同的方法将结石击碎，使碎石更容易经尿液流出体外。击碎结石的方法要视乎位置，如果结石位于肾脏或输尿管，我们可以利用「体外冲击波碎石术」，以非侵入性的方式将冲击波聚焦并传送把结石震碎成小块。如果结石位于膀胱或尿道，就要利用侵入性的方法，将内窥镜从尿道进入清理。当然，如果结石太大就需要用微创甚至开刀手术处理了。
泌尿系统结石可以毫无症状，那么是否值得每年进行检查，其实并无公论。但在医生的角度，如果发现病人有肾结石，不论是不能清除，还是病人选择不清除，医生都要定时监察病人的情况。因为一旦结石移位，在病人不察觉的情况下将泌尿系统堵塞，就有机会造成肾功能受损，影响深远。
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